Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PASD1Q8IV76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PASD1Q8IV76 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms