Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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RAB11FIP4Q86YS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB11FIP4Q86YS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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RAB11FIP4Q86YS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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RAB11FIP4Q86YS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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RAB11FIP4Q86YS3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB11FIP4Q86YS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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