Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSX9Q7RTT3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSX9Q7RTT3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms