Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYDE1Q6ZW31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYDE1Q6ZW31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYDE1Q6ZW31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms