Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP6Q6ZN66 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP6Q6ZN66 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBP6Q6ZN66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms