Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE3

CLPSL2, Colipase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL2Q6UWE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLPSL2Q6UWE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPSL2Q6UWE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms