Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZBED9Q6R2W3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ZBED9Q6R2W3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZBED9Q6R2W3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms