Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC70Q6NSX1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC70Q6NSX1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms