Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGP8Q6NSW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGP8Q6NSW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGP8Q6NSW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGP8Q6NSW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NANOGP8Q6NSW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NANOGP8Q6NSW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms