Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCTP1Q6DN14 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCTP1Q6DN14 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCTP1Q6DN14 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms