Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CLQ60I27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALS2CLQ60I27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALS2CLQ60I27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms