Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC38Q5VT99 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC38Q5VT99 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC38Q5VT99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms