Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM27D1Q5T7N8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM27D1Q5T7N8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 396.3 ms