Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HECTD3Q5T447 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HECTD3Q5T447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HECTD3Q5T447 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms