Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDZK1Q5T2W1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDZK1Q5T2W1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDZK1Q5T2W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms