Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SAPCD1Q5SSQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAPCD1Q5SSQ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms