Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIA9

CBWD5, COBW domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD5Q5RIA9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBWD5Q5RIA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBWD5Q5RIA9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBWD5Q5RIA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms