Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TTC38Q5R3I4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TTC38Q5R3I4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TTC38Q5R3I4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms