Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SIRPB2Q5JXA9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIRPB2Q5JXA9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIRPB2Q5JXA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIRPB2Q5JXA9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRPB2Q5JXA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms