Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF7

LINC01556, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01556, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01556Q5JQF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01556Q5JQF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01556Q5JQF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms