Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf116Q5BN46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf116Q5BN46 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms