Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC178Q5BJE1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC178Q5BJE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC178Q5BJE1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms