Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSP90AA4PQ58FG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HSP90AA4PQ58FG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HSP90AA4PQ58FG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms