Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB6CQ53S08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB6CQ53S08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms