Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIPR1Q53HC9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIPR1Q53HC9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms