Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP29Q52LW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGAP29Q52LW3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGAP29Q52LW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms