Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC01620Q4KN68 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC01620Q4KN68 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms