Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN20Q4JDL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN20Q4JDL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN20Q4JDL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms