Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC153Q494R4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC153Q494R4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC153Q494R4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms