Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q1T7F1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Q1T7F1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Q1T7F1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q1T7F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q1T7F1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q1T7F1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q1T7F1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q1T7F1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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