Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNOP1Q1ED39 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KNOP1Q1ED39 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNOP1Q1ED39 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms