Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDO1Q16878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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