Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 510.25□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.785e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 510.07□□□□□ -0.85e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 210.06□□□□□ -0.85e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 29.97□□□□□ -0.815e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-206ENST00000412128 863 ntTSL 319.09■□□□□ 0.653e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.393e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 313.91□□□□□ -0.183e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 59.18□□□□□ -0.943e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.973e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.053e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.173e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.233e-13■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 AC004674.1-201ENST00000458400 739 ntBASIC8.71□□□□□ -1.023e-10■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 ITPR2-201ENST00000242737 581 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.983e-9■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.383e-9■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 SRC-209ENST00000489153 551 ntTSL 34.51□□□□□ -1.692e-6■■■□□ 16.6
SRSF7Q16629 CROCCP2-201ENST00000362058 2029 ntTSL 220.9■□□□□ 0.947e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.427e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 CROCCP2-203ENST00000635081 1904 ntTSL 517.55■□□□□ 0.47e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)16.18■□□□□ 0.187e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 515.55■□□□□ 0.087e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.027e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.617e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 29.87□□□□□ -0.837e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.847e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.947e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.047e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.367e-8■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)16.68■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 511.46□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 59.9□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.455e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.445e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.395e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.035e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.165e-6■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.446e-7■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.446e-7■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 25.9□□□□□ -1.466e-7■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.656e-7■■■□□ 16.5
SRSF7Q16629 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.26e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.456e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 212.08□□□□□ -0.486e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.516e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 310.94□□□□□ -0.666e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 38.17□□□□□ -1.16e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 38□□□□□ -1.136e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 26.68□□□□□ -1.346e-7■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 221.01■□□□□ 0.952e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.152e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.42e-10■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-6■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 ADCY9-204ENST00000572288 772 ntTSL 410.73□□□□□ -0.694e-6■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 ADCY9-202ENST00000571467 569 ntTSL 59.94□□□□□ -0.824e-6■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 215.12■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-8■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-8■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.591e-8■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.61e-8■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 EHMT2-211ENST00000480912 3940 ntTSL 59.29□□□□□ -0.921e-8■■■□□ 16.4
SRSF7Q16629 RASSF1-207ENST00000482447 1711 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.12e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-204ENST00000395117 1745 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)20.18■□□□□ 0.826e-8■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-8■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.286e-8■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.366e-8■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.466e-8■■■□□ 16.3
SRSF7Q16629 CDKN1A-206ENST00000462537 553 ntTSL 314.63□□□□□ -0.076e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-9■■■□□ 16.2
SRSF7Q16629 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.136e-9■■■□□ 16.2
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