Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIP13Q15645 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIP13Q15645 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms