Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KA1Q15418 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KA1Q15418 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms