Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK1Q15118 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK1Q15118 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK1Q15118 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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