Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCLAFQ15004 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCLAFQ15004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCLAFQ15004 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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