Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBB3Q13509 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB3Q13509 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms