Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SF3B2Q13435 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SF3B2Q13435 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SF3B2Q13435 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SF3B2Q13435 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
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