Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLF1Q13351 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLF1Q13351 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF1Q13351 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms