Protein–RNA interactions for Protein: Q13277

STX3, Syntaxin-3, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX3Q13277 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX3Q13277 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX3Q13277 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX3Q13277 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX3Q13277 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX3Q13277 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX3Q13277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX3Q13277 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX3Q13277 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
STX3Q13277 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX3Q13277 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
STX3Q13277 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX3Q13277 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX3Q13277 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
STX3Q13277 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
STX3Q13277 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
STX3Q13277 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STX3Q13277 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX3Q13277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX3Q13277 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX3Q13277 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX3Q13277 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STX3Q13277 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX3Q13277 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms