Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK2Q13002 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK2Q13002 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK2Q13002 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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