Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPN13Q12923 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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PTPN13Q12923 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN13Q12923 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN13Q12923 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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