Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDE4BQ07343 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4BQ07343 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4BQ07343 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms