Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSTF1Q05048 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSTF1Q05048 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms