Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EXOSC10Q01780 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EXOSC10Q01780 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms