Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC1P78348 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC1P78348 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC1P78348 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms