Protein–RNA interactions for Protein: P62341

SELENOT, Thioredoxin reductase-like selenoprotein T, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOTP62341 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SELENOTP62341 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SELENOTP62341 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms