Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTBP2P56545 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTBP2P56545 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CTBP2P56545 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms