Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GYS2P54840 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GYS2P54840 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GYS2P54840 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GYS2P54840 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GYS2P54840 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GYS2P54840 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GYS2P54840 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYS2P54840 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYS2P54840 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS2P54840 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS2P54840 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS2P54840 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYS2P54840 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYS2P54840 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYS2P54840 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms